神兽一直是玩家追求的核心目标之一，它们不仅拥有独特的造型设计，还具备远超普通宝可梦的战斗能力。这些神兽通常分布在特定地点，需要满足特殊条件才能触发捕捉剧情，比如通关后探索隐藏区域、携带特定道具或完成支线任务。部分神兽甚至需要通过跨版本联动或特殊事件获取，因此提前了解它们的属性和捕捉方式至关重要。
创世神阿尔宙斯是公认的最强神兽之一，其能力源于携带的多种属性石板，可随时切换属性以克制对手。它的专属技能制裁光砾会根据石板属性改变攻击类型，几乎无法被常规战术针对。捕捉阿尔宙斯通常需要参与官方活动或完成特殊剧情，例如在特定遗迹中触发创世神话事件。另一只顶级神兽胡帕则凭借金色圆环召唤其他神兽协同作战，其解放形态的种族值极高，但需通过剧场版联动或隐藏任务解锁。
时空双神帝牙卢卡和帕路奇犽分别掌控时间与空间，它们的专属技能时光咆哮和亚空裂斩具有无视防御特性的效果。这两只神兽通常出现在版本对应的主线剧情后期，例如钻石珍珠系列中需在枪之柱完成最终对决。与之齐名的骑拉帝纳拥有两种形态，起源形态在毁坏的世界中能力大幅提升，需通过道具白金宝珠转换。
三圣鸟（急冻鸟、闪电鸟、火焰鸟）和三圣柱（雷吉洛克、雷吉艾斯、雷吉斯奇鲁）属于经典神兽群，虽然个体强度稍逊，但团队配合价值较高。它们的捕捉往往涉及解谜，例如在特定洞穴按顺序激活机关或携带古空棘鱼和吼鲸王触发布告石室事件。超梦作为初代人气神兽，拥有超高的特攻属性，常出现在克隆剧情关联的洞穴深处，需击败大量训练师后才能挑战。
幻之宝可梦如梦幻、雪拉比和基拉祈通常通过限时活动获取，其稀有度远超常规神兽。这类宝可梦虽不具备毁灭性战力，但专属技能和辅助能力极具战略意义。合众地区的黑白双龙捷克罗姆与莱希拉姆象征理想与真实，它们的交错火焰与交错闪电技能可引发额外效果，捕捉需在剧情最终阶段于巨人洞窟做出选择。
掌握神兽的分布规律与捕捉技巧能显著提升游戏体验，但需注意部分神兽对战斗队伍配置有严格要求。建议提前准备具备催眠、麻痹等控制技能的宝可梦，并携带大量高级球或大师球以提高成功率。神兽的养成方向应结合其特性调整，例如强化速度属性或搭配专属道具，最大限度发挥其战场统治力。
